Стоян Йотов роден в гр. София, завършил биология, специалност „Екология и опазване на природната среда” в Биологическия факултет на Софийския университет и „Околна среда и екологична политика” в Централно-европейския университет в Будапеща.

От 2011 г. и понастоящем работи по договор с Европейската Комисия като външен наблюдател на финансовия инструмент за околна среда LIFE на Европейския Съюз. Преди това, в продължение на 20 години, от 1990 до 2010 г., работи в неправителствения екологичен сектор, в това число като член и впоследствие председател на Дружеството за защита на хищните птици (от 1990 до 2001 г.) и на Сдружение „Природа назаем” (от 2001 до 2010 г.).

Участва активно в изпълнението и координацията на множество екологични и природозащитни проекти, като през годините установява и развива тесни професионални контакти с почти всички активисти и организации в тази сфера.

През 2008 г. е сред съучредителите на политическа партия „Зелените”, по-късно преименувана на „Зелено движение”. Оттогава членува в партията без прекъсване, като е заемал различни позиции в ръководните и контролните ѝ органи, включително и съпредседател, а в момента е член на Националния съвет.

Екологията е негова лична кауза, дълбоко убеждение и ключова опора в ценностната му система.